调试易

补充：数据库是sqlserver 2000

我这边模拟了下没有问题~换EXISTS试下
AND EXISTS(SELECT 1 FROM [dbo].[根据员工编号获得权限内文件夹编号列表](164) WHERE a.directory_id=directory_id)

换成楼上的EXISTS也不行，还是只有一条记录
如果吧表值函数的结果插入临时表，在查询就是正确的：IF object_id(N'tempdb..#tmp1') IS NOT NULL
DROP TABLE #tmp1
select * into #tmp1 from [dbo].[根据员工编号获得权限内文件夹编号列表](164)
select a.file_id,a.filename,b.directory_id,b.class_name
from upfiles a,upfiles_directory b 
where a.file_id in (25034,25033)
 and a.directory_id=b.directory_id
 and a.directory_id in (select directory_id from #tmp1)

函数是行内函数还是多语句函数？
如果是行内函数，改为多语句函数（RETURN TABLE 后有列定义）试试。

表值函数是这样写的，里面还引用了另外的表值函数，貌似已经是楼上说的多语句函数了Create FUNCTION [dbo].[根据员工编号获得权限内文件夹编号列表]
(
@Yuangong_ID int
)
RETURNS TABLE 
AS
RETURN 
select distinct a.Directory_ID from 
(select Directory_ID from upfiles_directory where 
dep_ID in (select dep_id from [dbo].[根据员工编号获得权限内部门专题编号列表](@Yuangong_ID))
and Directory_ID not in (select distinct Directory_ID from Upfiles_Directory_Power_Detail)
union all
(select Directory_ID from Upfiles_Directory_Power_Detail where Yuangong_ID=@Yuangong_ID)) a

Create FUNCTION [dbo].[根据员工编号获得权限内文件夹编号列表]
(
@Yuangong_ID int
)
RETURNS @T TABLE (Directory_ID INT)
AS
INSERT INTO @T
select distinct a.Directory_ID from 
(select Directory_ID from upfiles_directory where 
dep_ID in (select dep_id from [dbo].[根据员工编号获得权限内部门专题编号列表](@Yuangong_ID))
and Directory_ID not in (select distinct Directory_ID from Upfiles_Directory_Power_Detail)
union all
(select Directory_ID from Upfiles_Directory_Power_Detail where Yuangong_ID=@Yuangong_ID)) a
RETURN  
如果不是INT 就把INT换成你的类型

都是int，directory_id是自动增长的主键，在数据表中的类型也是int

我猜想有几种可能，
你的表值函数返回的是语句查询，因为SQL有一个优化机制，它可能直接把这个查询连接到外面的查询，而不是返回这个查询的值，然后跟外面连接查询，
这样，可能第一条查询，执行函数得到的值是1924，外面就查出一条，然后第二查询的时候，就没有再执行这个函数，而直接取上次得到的1924，这样第二条就不匹配~
最终结果就只有一条以上仅是根据优化机制进行的猜想~~PS：查询是表乘起来的积一条一执行，一条一条判断合不合格的

太深奥了，^_^，没有CSDN日子怎么过哇

#7 是行内函数，#8 才是多语句函数。
虽然问题解决了，但是我怀疑你是否补丁没打。
找了台 SQL Server 2000，行内函数结果是正确的。
CREATE FUNCTION f_numbers(@min INT,@max INT)
RETURNS TABLE
AS
RETURN (
    SELECT NUMBER
     FROM master..spt_values
    WHERE TYPE = 'p'
      AND NUMBER BETWEEN @min AND @max
)
GOSELECT *
  FROM (
        SELECT 1 AS n UNION ALL
        SELECT 3 UNION ALL
        SELECT 5
       ) A
 WHERE n in (SELECT number FROM dbo.f_numbers(2,10))
n           
----------- 
          3 
          5